Modelowanie epidemii dwóch prędkości: związana ze służbą zdrowia i pozostała
22-05-2020Na podstawie danych udostępnionych przez Główny Inspektorat Sanitarny (GIS) przeprowadzono modelowanie epidemii dwóch prędkości. Wydzielono zakażenia związane ze służbą zdrowia, w tym zakażenia pacjentów w szpitalach i pacjentów opieki długoterminowej oraz personel medyczny, ze względu na inne możliwości redukcji kontaktów w tym sektorze. Pozostałe zakażenia zostały połączone w jednej grupie, biorąc pod uwagę, że ogniska pozamedyczne nie są wyodrębnione w dostępnych danych.
Przyjęto założenia, że pacjenci szpitalni nie mają kontaktów z osobami poza szpitalami i przebywają w szpitalu średnio 5,3 dni[1] , zaś pacjenci w opiece długoterminowej przebywają tam stale. Personel medyczny pozostaje w grupie "medycznej", ale kontaktuje się z pozostałymi osobami w populacji ogólnej.
Analiza parametrów modelu i predykcji wskazuje na:
- dobrą kontrolę epidemii w kompartmencie służby zdrowia
- ponad dwukrotny wzrost parametru β2 opisującego intensywność transmisji w kompartmencie pozostałej populacji
- mniej optymistyczne prognozy niż w modelu SEIR, który nie bierze pod uwagę wygaszenia ognisk w slużbie zdrowia
Rysunek 1. Dzienne liczby przypadków w modelu dwóch prędkości. Kropkami oznaczono obserwowane liczby przypadków związanych ze służbą zdrowia i pozostałych przypadków (źródło danych: Główny Inspektorat Sanitarny), a także łączną liczbę wszystkich rozpoznań. Linie ciągłe odpowiadają predykcji z modelu estymowanego dla dwóch okresów danych (pierwszy od 06.04 do 05.05, a drugi od 05.05 do 21.05 ). Dla obu grup przyjęto ten sam parametr σ-1=3,5, pozostałe parametry dotyczące poziomu kontaktów (β1, β2) oraz czasu do rozpoznania (γ1-1, γ2-1) zostały wyestymowane na podstawie danych. Predykcja łącznej liczby zachorowań jest obliczona jako suma predykcji dla kompartmentu służby zdrowia i kompartmentu pozostałej populacji.